银河铁道999全集动画共113集，银河铁道999全集动画讲述的是主角星野铁郎受母亲的影响，希望搭上银河铁道999，到达可以获得免费改造成机械身体权利的安达罗星云，母亲却被机械伯爵所杀，后来遇上谜样的女子，给他的车票，于是搭上列车，展开旅程，途中经过宇宙中各种不同的星星，发生各种事情。
动画片《银河铁道999》有点像人类文明发展史，也有点像对人类社会的观察，故事藉由主角搭乘999号银河铁道，经由一个个星球不同的文明相貌，表达作者不同的观点及感想，这在当时他们那一辈的作家像手冢治虫等人常用的手法：短篇的故事表达出很深刻的观察。
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